MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 20843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010717	GC	3	6	10	15	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010717	CAGC	2	8	18	25	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010717	GAT	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010717	CCA	2	6	1494	1499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_010717	AAAC	2	8	1548	1555	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010717	CAC	2	6	1593	1598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010717	GTT	2	6	2806	2811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010717	GC	3	6	2876	2881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010717	CGC	2	6	2975	2980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_010717	CA	3	6	3018	3023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010717	CTG	2	6	3094	3099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010717	CG	4	8	3109	3116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010717	G	6	6	3150	3155	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010717	CGG	2	6	3179	3184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010717	AG	3	6	3203	3208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010717	CAAT	2	8	3317	3324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010717	GTCC	2	8	3338	3345	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010717	CAG	2	6	3360	3365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010717	TC	3	6	3367	3372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010717	CTT	2	6	3494	3499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010717	TTG	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010717	ATC	2	6	3559	3564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010717	GTT	3	9	3772	3780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010717	CCTG	2	8	3896	3903	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010717	CCGT	2	8	3911	3918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010717	C	6	6	5156	5161	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_010717	TGT	2	6	5202	5207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010717	CCA	2	6	7672	7677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_010717	ATCGCG	2	12	7692	7703	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010717	CGGTG	2	10	7714	7723	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010717	GAC	2	6	7731	7736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010717	CGG	2	6	8684	8689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010717	GCCT	2	8	9629	9636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010717	TCG	2	6	9714	9719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010717	CGG	2	6	9821	9826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010717	ATC	2	6	11146	11151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010717	AAC	2	6	11198	11203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010717	CACTG	2	10	11295	11304	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_010717	TCA	2	6	11917	11922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010717	CA	4	8	11924	11931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010717	AGT	2	6	12764	12769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010717	TGG	2	6	13195	13200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010717	CAACA	2	10	13614	13623	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_010717	T	7	7	13662	13668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010717	TGT	2	6	13674	13679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010717	GCGA	2	8	13751	13758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010717	GCT	2	6	13761	13766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010717	GCA	2	6	13798	13803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010717	CG	3	6	13825	13830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010717	GC	3	6	13847	13852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010717	ATG	2	6	14936	14941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010717	GGC	2	6	14957	14962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010717	ACGGT	2	10	14978	14987	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010717	GCGCC	2	10	14997	15006	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_010717	GCC	2	6	16488	16493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_010717	TGC	2	6	16527	16532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010717	CG	3	6	16548	16553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010717	GCA	2	6	16665	16670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010717	TGA	3	9	16691	16699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010717	GAT	2	6	16701	16706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010717	CAG	2	6	16716	16721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010717	CAC	2	6	16828	16833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_010717	AGC	2	6	16846	16851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010717	TCG	2	6	16890	16895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010717	AAAG	2	8	16934	16941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010717	CGA	2	6	17004	17009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010717	GTC	2	6	17010	17015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010717	A	7	7	17081	17087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010717	GCT	2	6	17090	17095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010717	AGG	2	6	18149	18154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010717	GCC	2	6	18158	18163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010717	TG	3	6	18229	18234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010717	A	7	7	18327	18333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010717	GC	3	6	18345	18350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010717	GCT	2	6	19639	19644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010717	ACT	2	6	19652	19657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010717	AGC	2	6	19665	19670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010717	CAA	2	6	19704	19709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010717	ACC	2	6	21972	21977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_010717	CA	3	6	21989	21994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010717	GCC	2	6	22006	22011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010717	C	6	6	22035	22040	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_010717	CGA	2	6	22045	22050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010717	GCA	2	6	22086	22091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010717	CGTG	2	8	22665	22672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010717	CCGG	2	8	22678	22685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010717	CGC	2	6	22760	22765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_010717	GCC	2	6	22774	22779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010717	TCGA	2	8	22814	22821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010717	CG	3	6	22832	22837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010717	GGC	2	6	22854	22859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010717	CAGCG	2	10	22879	22888	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010717	GTCT	2	8	22940	22947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010717	AGC	2	6	22951	22956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010717	GCA	2	6	22994	22999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010717	AAC	2	6	23059	23064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010717	GTT	2	6	24175	24180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010717	GCG	3	9	25374	25382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010717	TGCC	2	8	25470	25477	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_010717	TGGC	2	8	25495	25502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010717	CG	3	6	25783	25788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010717	CA	3	6	25806	25811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010717	CAC	2	6	25907	25912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_010717	GC	3	6	25972	25977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010717	GCG	3	9	25991	25999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010717	AGC	3	9	26007	26015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010717	CCAGA	2	10	26027	26036	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_010717	TGG	2	6	26097	26102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010717	TGCG	2	8	26177	26184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010717	TGCC	2	8	26843	26850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010717	CGG	2	6	26901	26906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010717	ACC	2	6	26922	26927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_010717	GTC	2	6	26980	26985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010717	GTC	2	6	26987	26992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010717	GCG	2	6	27002	27007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010717	GGCAC	2	10	27325	27334	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_010717	GGCGG	2	10	27335	27344	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
118	NC_010717	AGC	2	6	27348	27353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010717	CGC	2	6	27360	27365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_010717	CGGTTG	2	12	27375	27386	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_010717	GCAC	2	8	27401	27408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010717	GCG	2	6	27435	27440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010717	GCG	2	6	27462	27467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010717	CG	4	8	27490	27497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010717	GCC	2	6	27514	27519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_010717	GA	3	6	28774	28779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010717	GC	3	6	29012	29017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010717	CGC	2	6	29190	29195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_010717	AAC	2	6	29231	29236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010717	CG	3	6	29258	29263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010717	GC	3	6	29277	29282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010717	GCT	2	6	29302	29307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010717	TG	3	6	30424	30429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010717	GGA	2	6	30444	30449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010717	GGC	2	6	30503	30508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010717	ATG	2	6	30516	30521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010717	TGA	2	6	30608	30613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010717	CGT	2	6	30614	30619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010717	CGG	2	6	30626	30631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010717	TCAC	2	8	30640	30647	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010717	GGGAG	2	10	30680	30689	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010717	ACC	2	6	30705	30710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_010717	GGC	2	6	31023	31028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_010717	GCA	2	6	31048	31053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010717	AGT	3	9	31079	31087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010717	CGG	2	6	31184	31189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_010717	CTT	2	6	31208	31213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_010717	CTT	2	6	31223	31228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_010717	GGTG	2	8	31229	31236	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_010717	TCA	2	6	31346	31351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_010717	GAC	2	6	31371	31376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_010717	CAC	2	6	31395	31400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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156	NC_010717	TGA	2	6	31535	31540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010717	TCC	2	6	31543	31548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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159	NC_010717	TCT	2	6	31703	31708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_010717	TGC	2	6	31730	31735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_010717	GC	3	6	31824	31829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
163	NC_010717	GCC	2	6	31846	31851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_010717	TCT	2	6	31925	31930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_010717	TCA	2	6	32183	32188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_010717	CAG	3	9	32214	32222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_010717	GAA	2	6	32322	32327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_010717	CTG	2	6	32560	32565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_010717	AAG	2	6	33222	33227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
180	NC_010717	TCC	2	6	33238	33243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_010717	CTG	2	6	33264	33269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_010717	GAC	2	6	33372	33377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_010717	TCG	2	6	33517	33522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_010717	TCG	2	6	33661	33666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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231	NC_010717	CCT	2	6	39224	39229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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252	NC_010717	GC	3	6	43193	43198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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256	NC_010717	CGG	2	6	43317	43322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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270	NC_010717	TTC	2	6	45724	45729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_010717	ACT	2	6	45763	45768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_010717	AGC	2	6	45809	45814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_010717	GAT	2	6	46941	46946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_010717	ATCC	2	8	47022	47029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
278	NC_010717	CTGA	2	8	47618	47625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
279	NC_010717	GCG	2	6	47898	47903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_010717	T	6	6	47926	47931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_010717	GCGTTT	2	12	49499	49510	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
282	NC_010717	GCC	3	9	49525	49533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_010717	GCTTG	2	10	49600	49609	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
284	NC_010717	GC	3	6	50579	50584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
285	NC_010717	GCA	2	6	50614	50619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_010717	TGC	2	6	50648	50653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_010717	CAG	2	6	50752	50757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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433	NC_010717	CCG	2	6	83616	83621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
434	NC_010717	TG	3	6	83640	83645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_010717	CTGAG	2	10	84515	84524	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
441	NC_010717	CCG	3	9	84566	84574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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450	NC_010717	TGT	2	6	85947	85952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_010717	CT	3	6	86025	86030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
454	NC_010717	CTG	2	6	86103	86108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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459	NC_010717	TGG	2	6	86247	86252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_010717	TCG	3	9	86596	86604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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465	NC_010717	CG	3	6	86642	86647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
466	NC_010717	CAAT	2	8	86677	86684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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468	NC_010717	GC	3	6	86838	86843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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474	NC_010717	GCA	2	6	87128	87133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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